Хроника новостей

Рoссийскиe учeныe рaзрaбoтaли нeйрoсeть, кoтoрaя пoмoжeт пoнять, нaскoлькo эффeктивны прoтив нoвыx штaммoв и вирусoв вырaбaтывaющиeся пoслe примeнeния вaкцин aнтитeлa и нужнo ли мoдифицирoвaть иx сoстaв. Прoгрaммa укaжeт нa нaибoлee привлeкaтeльныe про aнтитeл мeстa в структурe пaтoгeнa. Инструмeнт ужe aпрoбирoвaн в НИЦЭМ им. Н. Ф. Гaмaлeи — тaм oцeнили эффeктивнoсть eгo примeнeния про кoрoнaвирусa, a сeйчaс исслeдoвaтeли прoвeряют вoзмoжнoсть испoльзoвaния ИИ про вирусa гриппa. Экспeрты oтмeчaют, чтo пoлучeнныe знaния пригoдятся биoлoгaм и иммунoлoгaм рядом рaзрaбoткe вaкцин и тeрaпeвтичeскиx прeпaрaтoв нa oснoвe aнтитeл.

Нaйти свoe столица

Воздушная прослушка: в России начали (про)являть болезни по анализу выдоха

Чисто наше дыхание позволяет измерять рак и проблемы с сердцем

Овладевание взаимодействия штаммов и антител позволяет правильнее спрогнозировать эпидемический развитие, а также создать новые препараты исполнение) борьбы с патогенами.

Исследователи с группы «Биоинформатика» Института искусственного интеллекта AIRI создали программу, которая укажет получай участки связывания антител с белками вирусов и бактерий. Ее обозначение — SEMA (Spatial Epitope Modelling with Artificial Intelligence — пространственное имитация эпитопов с помощью искусственного интеллекта). Эпитопами называются привлекательные для того антител участки получи и распишись поверхности вируса, своеобразные «посадочные площадки» ради антител.

По словам руководителя научной группы Ольги Кардымон, измерение эпитопов на поверхности белков — задание не новая, как ни в SEMA исследователи в первый раз использовали для ее решения белковую языковую персептрон, а для удобства биологов создали веб-интерфейс, с тем чтобы они не тратили срок на изучение стих.

Опознать антитело

Колючее красота: что известно о вакцине ото ротавируса

Российские ученые готовят для того детей новую прививку

— Возьми сегодняшний день разработан семейство разрозненных инструментов пользу кого изучения белков в контексте их взаимодействия с антителами, — рассказала «Известиям» старший ученый сотрудник AIRI Танюта Шашкова. — Получение и отряд результатов работы с данными инструментами представляет большую хитрость и занимает много времени у исследователей. Ты да я стараемся создать удобную платформу для того исследования белков с применением современных моделей ИИ, текущая модифицирование SEMA — её увертюра, например, у нее принимать удобный для биологов веб-интерфейс с визуализацией.

Бегло и надежно

Ученые считают, что-то инструмент будет полезен биотехнологическим институтам и компаниям, работающим надо созданием вакцин и препаратов в (видах терапии вирусных и бактериальных заболеваний. Работа инструмента велась в тесном контакте с учеными изо Центра имени Гамалеи.

— С через SEMA можно бойко просканировать несколько новых антигенных последовательностей и дать оценку угрозу ухода через иммунитета социально-значимых вариантов вирусов, к примеру сказать, новых штаммов вируса гриппа иль нового коронавируса, — рассказал ученый сотрудник лаборатории молекулярной биотехнологии и Вотан из разработчиков вакцины Калипсо V, кандидат биологических наук Митяша Щербинин.

Опознать бактериолизин

Одни получай всех: в России появятся мира-системы для анализа всех вирусов

Построение ученых поможет быстрее обнаруживать новые штаммы известных заболеваний

— Взаимопонимание антигенных взаимоотношений промежду циркулирующими штаммами позволяет использовать до конца полученные знания с целью разработки эффективных вакцин и других препаратов, — отметила старший ученый сотрудник НИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи, соперник медицинских наук Муся Асатрян. — Это, в свою хвост, позволяет прогнозировать эпидемический судебное дело с более высокой точностью и пить взвешенные решения согласно ограничительным мероприятиям. В некоторых случаях основанные для ИИ решения могут учить (кого). Ant. утаивать лучший результат, нежели традиционные методы.

Последние, объединение словам заведующего лабораторией НИИ физико-химической биологии МГУ им. М.В. Ломоносова Романа Зиновкина, включают в себя экспериментальную порция, когда к вирусу «в пробирке» добавляют антитела и смотрят держи их ингибирующую одаренность.

— Однако до экспериментов делают биоинформатический исследование, когда изучается конструкция поверхностных белков вируса и выдвигаются гипотезы о томище, как они соединяются с клеточным рецептором, — пояснил волхв. — На самом деле о вирусах знакомо уже довольно отбою), что позволяет с определенной достоверностью повыбрать участки, которые отвечают ради связывание с клеткой. Да антитела для них отдаленно не всегда получаются до того хороши, насколько нужно. Коль скоро нейросеть действительно увеличивает преимущество выбрать правильный гари белка, она признаться сказать упростит и ускорит плод трудов рабочих вакцин.

Распознать антитело

Фото: ИЗВЕСТИЯ/Крыся Кормилицына

Исследователи изо AIRI продолжают работу надо расширением функционала программы. Сверху ресурсе уже появилась допустимость прогнозировать места получай поверхности белка, идеже расположены гликаны. Сии вещества покрывают белки, сохраняют их структуру и регулируют его функции. Однако и они могут связывать реализации контакта вируса и антитела.

Результаты работы были опубликованы в международной научном журнале.

Читайте вот и все

Реклама